天然药物化学实验室隶属北京大学药学院药学实验教学中心，承担药学院六年长学制学生及夜大学本科生天然药物化学实验的教学任务。在学校和院系有关领导的大力关心和经费支持下，天然药物化学实验室配有整体通风设备以保证学生实验安全与身体健康。每间实验室均配有先进齐全的仪器设备，包括冷阱、旋转蒸发仪、循环水式真空泵、水浴锅、电加热板、电加热套、紫外灯、电子天平、真空干燥箱、烘箱、超声清洗仪、电冰箱、离心机等，能很好满足天然药物化学实验课教学的需求。

承担天然药物化学实验教学任务的教师有7人，其中教授1人，副教授2人，讲师3人，主管技师1人。教师中40岁以上3人，30岁以上4人，形成了老中青结合、人员稳定、结构合理的教师梯队。另外每年还有本专业的富有责任心的研究生作为助教参加实验教学工作。

天然药物化学实验组热心实验研究，在教学工作中，采取集体备课的模式，共同研讨教学方案方法，形成了团结协作、共同提高的富有凝聚力的团队。教学工作中尤其注重年轻教师教学能力的锻炼培养，对每一位青年教师都由经验丰富的教师加以指导和帮助，并集体对其教学水平与教学效果进行综合评估，指明优、缺点，极大的提高了青年教师的教学水平和教学质量。实验室技术人员则精心准备、热心服务，共同完成教学任务。

实验室有专人管理，实行制度化、规范化、专业化、科学化的管理模式。仪器破损后按学校有关规定进行赔偿。实验室对实验过程产生的产品及废溶剂进行回收，部分可以回收再利用的溶剂进行再利用，不能回收再利用的由药学院统一处理，上述措施既减少对环境的污染，节约了教学经费，也提高了学生的节约意识和环保意识。